当家は分家で、身内の葬儀で本家の宗派に合わせないといけないでしょうか。

以前は、本家に合わせていましたが、現代では、分家の初代であれば初代の考えで本家に宗派を合わす合わさないは自由と存じます。宗派を替えられても問題はないと存じます。